More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4394 on replicon NC_009433
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  59.49 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  41.58 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  43.54 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 		 236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  42.05 
 
 		 217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  41.46 
 
 		 228 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  45.63 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  39.3 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  37.86 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  38.35 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  38.55 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  42.49 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  37.5 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  47.65 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  45.08 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  41.09 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  43.55 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  40 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  40.96 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  36.53 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  39.51 
 
 		 224 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  37.14 
 
 		 248 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  42.23 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  40.29 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  35.71 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  33.65 
 
 		 269 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  37.91 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  33.16 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  39.2 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  40.62 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 380 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  33.16 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  34.18 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  32.65 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 546 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  35.23 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.17 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  38.95 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  32.16 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  41.59 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  36.07 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.53 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.69 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  43.97 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.29 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.53 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  32.59 
 
 		 534 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  30.66 
 
 		 525 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.94 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  33.13 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  33.51 
 
 		 665 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  32.13 
 
 		 537 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.82 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  33.61 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.82 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.53 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  38.53 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  30.43 
 
 		 522 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  39.09 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.96 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.14 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  29.7 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.61 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  31.22 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.5 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  31.55 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.5 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.09 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  33.65 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  33.85 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  33.93 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  33.93 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  39.82 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  40.95 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  31.22 
 
 		 534 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  36.7 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  36.7 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.84 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.76 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.76 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  36.07 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  36.07 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  36.07 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  35.36 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  36.07 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 534 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  28.72 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 534 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  30.67 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.58 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>