112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3595 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  39.17 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  38.3 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  35.04 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  31.78 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  31.93 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  32.35 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  29.96 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  32.77 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  32.17 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  30.67 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  27.64 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  28.51 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  30.34 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.89 
 
 		 578 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.89 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.88 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  29.71 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.11 
 
 		 662 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.84 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  27.31 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  27.31 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  32.47 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  28.44 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.12 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.36 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.61 
 
 		 462 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  31.14 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  28 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.93 
 
 		 542 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.96 
 
 		 522 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  28.51 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  30.64 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.93 
 
 		 542 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.93 
 
 		 542 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  27.66 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  29.79 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  40.91 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 500 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.29 
 
 		 569 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.05 
 
 		 415 aa  52.4  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 564 aa  52  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  37.35 
 
 		 380 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.78 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  27.85 
 
 		 503 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  30.94 
 
 		 511 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.27 
 
 		 546 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.53 
 
 		 578 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  32.67 
 
 		 542 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  32.67 
 
 		 554 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  31.72 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.25 
 
 		 426 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  31.17 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  29.24 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  28.15 
 
 		 562 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  28.15 
 
 		 565 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  34.25 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  24.36 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.38 
 
 		 537 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  25.57 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35.46 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  39.76 
 
 		 506 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  32.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  28.95 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  28.33 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  32.94 
 
 		 517 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  32.67 
 
 		 548 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  32.37 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  48.65 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.37 
 
 		 521 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3978  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  30.94 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.04 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  34.52 
 
 		 547 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  28.26 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5600  DNA recombinase, putative, truncation  26.8 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  39.24 
 
 		 515 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  32.94 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  35.97 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  34.52 
 
 		 561 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  22.84 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.73 
 
 		 521 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 519 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.34 
 
 		 520 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.78 
 
 		 540 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  26.34 
 
 		 558 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>