More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2389 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  60.35 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  59.48 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  59.73 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  55.16 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  55.3 
 
 		 216 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  54.71 
 
 		 227 aa  221  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  51.57 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  59.11 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  59.56 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  47.11 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  51.75 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  52.31 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  49.56 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  49.56 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  44.86 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  46.15 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  47.75 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  49.57 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  63.76 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  41.18 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  42.34 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  54.75 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  45.33 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  42.6 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  48.65 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  42.53 
 
 		 268 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  43.68 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  34.93 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  41.15 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  35.98 
 
 		 264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  35.93 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  34.71 
 
 		 242 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  35.06 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  35.54 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  40.62 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  42.68 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.44 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  35.29 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  40.69 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.36 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.43 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  33.48 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  33.14 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  33.91 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  31.76 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  35.59 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.55 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.98 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  30.25 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.98 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  35.19 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.98 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  36.84 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  33.04 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  33.54 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.09 
 
 		 665 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.68 
 
 		 462 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  31.28 
 
 		 484 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.13 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36.18 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.49 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  40.38 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  33.91 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.18 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  35.1 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  35.1 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  35.1 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  35.85 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  34.3 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  30.84 
 
 		 484 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.53 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.53 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  35.57 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  36.54 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  39.84 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  35.53 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.81 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  31 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  34.64 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.88 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  32.72 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  35.71 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  31.87 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  31.93 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  40.37 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  30.46 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>