More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3655 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  99.06 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  69.23 
 
 		 197 aa  280  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  72.87 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  72.34 
 
 		 194 aa  275  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  71.05 
 
 		 201 aa  275  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  61.93 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  61.93 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  61.93 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  65.04 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.88 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  44.27 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  44.27 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  44.27 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  43.37 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.36 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  41.58 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.17 
 
 		 201 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40.32 
 
 		 188 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.78 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  39.58 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  39.68 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  45.58 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.31 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  40.54 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.55 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.69 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  45.27 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.55 
 
 		 187 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.55 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.75 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.71 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  39.09 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  39.04 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  39.04 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  39.04 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.84 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.99 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  36.89 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  39.44 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  39.44 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  43.92 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  43.21 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.76 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.76 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.65 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  34.95 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.61 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.58 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  38.55 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  45.27 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.36 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.76 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  41 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  38.04 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  41.18 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  41.18 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  37.11 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  36.27 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  42 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.25 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  42.68 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  43.83 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.61 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.56 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  37.84 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  37.84 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.7 
 
 		 197 aa  105  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.34 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.86 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  37.7 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  45.27 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  45.27 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.36 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  38.25 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.76 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>