More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0381 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  296  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  73.72 
 
 
199 aa  203  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  73.72 
 
 
199 aa  203  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  73.72 
 
 
199 aa  203  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  63.77 
 
 
209 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  66.41 
 
 
201 aa  167  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  60.56 
 
 
197 aa  167  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  60.14 
 
 
194 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  65.04 
 
 
212 aa  159  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  64.52 
 
 
213 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  41.86 
 
 
188 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  41.86 
 
 
214 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.06 
 
 
201 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  40 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  40 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  42.62 
 
 
198 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  40.62 
 
 
189 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  40 
 
 
281 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  45.31 
 
 
193 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.27 
 
 
196 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  43.75 
 
 
203 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  42.19 
 
 
186 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  37.5 
 
 
181 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.77 
 
 
203 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  43.09 
 
 
185 aa  88.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  43.09 
 
 
185 aa  88.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  42.28 
 
 
188 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  43.08 
 
 
197 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 
199 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 
185 aa  88.2  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  39.53 
 
 
197 aa  88.2  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  40.32 
 
 
196 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  41.53 
 
 
184 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  42.06 
 
 
191 aa  87.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.41 
 
 
188 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  42.06 
 
 
191 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 
186 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.19 
 
 
185 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
205 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  40.52 
 
 
184 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  40.52 
 
 
195 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  41.41 
 
 
188 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  41.41 
 
 
185 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  46.34 
 
 
209 aa  86.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  40.68 
 
 
184 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.46 
 
 
192 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  36.64 
 
 
184 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.76 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  42.64 
 
 
190 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  42.64 
 
 
190 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  42.64 
 
 
190 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 
188 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  42.28 
 
 
219 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
197 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
197 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  37.69 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  42.28 
 
 
197 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  42.28 
 
 
219 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  42.19 
 
 
193 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  42.28 
 
 
219 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  43.9 
 
 
185 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  37.98 
 
 
184 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  41.09 
 
 
180 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 
187 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  40.48 
 
 
196 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 
195 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  39.52 
 
 
184 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.72 
 
 
188 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.62 
 
 
197 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.62 
 
 
185 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  43.55 
 
 
189 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  43.93 
 
 
205 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2399  resolvase domain-containing protein  42.5 
 
 
197 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  40.62 
 
 
188 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.98 
 
 
201 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  40.62 
 
 
187 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  40.62 
 
 
190 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  42.64 
 
 
224 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.84 
 
 
184 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 
194 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  35.38 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  39.53 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.92 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.88 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  39.02 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.27 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.84 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.53 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  41.22 
 
 
205 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  41.22 
 
 
205 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  36.15 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  40.83 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  44.83 
 
 
206 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 
307 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  41.07 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 
307 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  41.51 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  41.51 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>