More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6610 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  63.87 
 
 		 214 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  65.57 
 
 		 281 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  70.17 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  57.63 
 
 		 194 aa  210  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  62.71 
 
 		 195 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  62.15 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  54.24 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  57.39 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  53.01 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  55.37 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  50.55 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  57.24 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  53.75 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  47.85 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  51.12 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  51.48 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  51.48 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  49.7 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  49.44 
 
 		 197 aa  160  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  48.02 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  49.16 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  52.26 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  48.44 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  48.04 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.7 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  48.31 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  47.12 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  46.77 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  46.77 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  45.16 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  48.31 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  46.52 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  48.31 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  54.55 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  47.03 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  49.15 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  48.35 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  47.8 
 
 		 190 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  43.02 
 
 		 196 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  47.8 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  45.51 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  46.89 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  52.41 
 
 		 307 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  52.41 
 
 		 307 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  43.59 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  43.59 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  45.7 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  51.39 
 
 		 309 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  46.33 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  37.97 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  48.03 
 
 		 201 aa  140  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  43.33 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  42.46 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  42.46 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  53.12 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.51 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  51.37 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  44.26 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  51.37 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  46.77 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  46.77 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  50 
 
 		 176 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  53.17 
 
 		 190 aa  130  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  52 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  42.22 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  42.22 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  43.09 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  43.09 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  43.09 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  52.42 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  42.22 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  44.74 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  45.2 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  39.69 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  39.69 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  39.69 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  44.13 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  44.13 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  44.26 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  45.75 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  52 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  48.18 
 
 		 305 aa  124  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  48.18 
 
 		 309 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>