More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6785 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  98.34 
 
 
184 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  62.78 
 
 
214 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  67.96 
 
 
183 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  59.78 
 
 
189 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  62.71 
 
 
192 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  56.99 
 
 
189 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  55.8 
 
 
184 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  63.28 
 
 
281 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  50.26 
 
 
194 aa  197  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  54.59 
 
 
188 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  54.14 
 
 
188 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  50.54 
 
 
188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  52.31 
 
 
203 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  52.41 
 
 
186 aa  177  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 
201 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  51.1 
 
 
188 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  53.8 
 
 
199 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  52.75 
 
 
182 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  51.35 
 
 
185 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  56.8 
 
 
191 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  56.8 
 
 
191 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  51.11 
 
 
189 aa  174  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  51.93 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  51.1 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  49.47 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  51.67 
 
 
193 aa  171  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  51.1 
 
 
184 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  50 
 
 
184 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  49.45 
 
 
185 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  51.65 
 
 
191 aa  167  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 
194 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  49.47 
 
 
193 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  49.45 
 
 
185 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  48.9 
 
 
185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  50 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  50 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  47.59 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  46.41 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44.85 
 
 
203 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  49.72 
 
 
193 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  60.71 
 
 
209 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 
189 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  50.56 
 
 
188 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  53.07 
 
 
219 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  50.56 
 
 
190 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  47.03 
 
 
192 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  50.56 
 
 
187 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
188 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 
197 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 
197 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  55.84 
 
 
197 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  51.98 
 
 
228 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  55.71 
 
 
309 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  52.75 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  45.86 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  52.74 
 
 
307 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  52.74 
 
 
307 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  44.2 
 
 
186 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  53.63 
 
 
190 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  58.75 
 
 
209 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.03 
 
 
224 aa  147  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  60 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  43.89 
 
 
201 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  46.56 
 
 
190 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  46.56 
 
 
190 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  46.56 
 
 
190 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.28 
 
 
218 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  45.36 
 
 
198 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  45.9 
 
 
197 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.45 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  51.41 
 
 
176 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  45.09 
 
 
187 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 
193 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  46.11 
 
 
206 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  51.91 
 
 
201 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  46.33 
 
 
189 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  46.21 
 
 
181 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  43.39 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  46.33 
 
 
189 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 
193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 
186 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 
293 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  47.5 
 
 
208 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  52.99 
 
 
326 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  46.24 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  49.34 
 
 
305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  52.63 
 
 
206 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  40.91 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.78 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.78 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 
201 aa  131  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  45.7 
 
 
204 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  52.99 
 
 
294 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>