More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1852 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  91.4 
 
 		 191 aa  343  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  68.78 
 
 		 194 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  68.78 
 
 		 194 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  68.78 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  68.78 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  68.78 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  68.45 
 
 		 197 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  49.21 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  49.21 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  49.21 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  49.74 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  49.74 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  59.21 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  59.21 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  50.83 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 188 aa  164  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  48.91 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  48.91 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  48.63 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  48.63 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  44.9 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  48.9 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  49.72 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  49.16 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  48.6 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  44.39 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.77 
 
 		 182 aa  158  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  46.89 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.74 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  46.89 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  46.89 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  44.74 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  52.32 
 
 		 184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  46.74 
 
 		 188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  46.11 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  46.37 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  42.02 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  46.93 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  44.68 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  53.47 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  45.95 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  43.32 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.7 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  41.45 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  45 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  46.37 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  43.81 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  43.58 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  42.63 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  46.89 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  44.39 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.93 
 
 		 309 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.86 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  43.32 
 
 		 184 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  51.53 
 
 		 324 aa  140  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  44.44 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  41.75 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  46.11 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.62 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 307 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 307 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.25 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  44.44 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  43.32 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  42.62 
 
 		 201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  50.35 
 
 		 293 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.33 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  50.35 
 
 		 326 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  53.03 
 
 		 133 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.36 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  49.65 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  42.78 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.41 
 
 		 197 aa  130  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  50.35 
 
 		 310 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  50.94 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  43.85 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>