More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0955 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  72.34 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  72.34 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  71.96 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  72.87 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  69.63 
 
 		 201 aa  265  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  60.14 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  43.55 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  42.25 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  42.78 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  43.72 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.99 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.62 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  41.15 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  41.15 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  41.15 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.41 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  40.98 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.15 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  41.3 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  41.85 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  41.85 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  47.89 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  40.33 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  39.9 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.88 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  39.66 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.11 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.74 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  39.11 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.23 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  39.27 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.98 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.3 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  39.01 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  38.92 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  38.92 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  45.25 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  39.78 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  40.53 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  39.15 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  39.46 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  41.71 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  39.46 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  39.36 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  39.46 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  32.09 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  45.41 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  38.66 
 
 		 309 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  39.8 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  38.17 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  38.17 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  38.17 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  41.25 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  47.92 
 
 		 293 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  47.92 
 
 		 326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.36 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.66 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.06 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  41.27 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  41.21 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  39.47 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  39.68 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.43 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  42.78 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.47 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  39.46 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  39.47 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  39.47 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.71 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>