More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0585 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  55.98 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  53.59 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  57.78 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  52.2 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  51.35 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  49.46 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  50 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  51.09 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  54.65 
 
 		 191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  54.65 
 
 		 191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  51.1 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  50.81 
 
 		 204 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  50.81 
 
 		 204 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  47.57 
 
 		 203 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  47.31 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  47.28 
 
 		 201 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  46.96 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  47.83 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  47.83 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  49.17 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  53.57 
 
 		 307 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  53.57 
 
 		 307 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  48.11 
 
 		 219 aa  154  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  46.74 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  48.68 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  49.73 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  55.48 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  48.65 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  54.49 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  46.74 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  47.51 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  46.2 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  48.65 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  47.31 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  47.31 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  47.31 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  48.91 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  50.61 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  46.74 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  46.74 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  55.17 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  48.59 
 
 		 218 aa  148  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  45.05 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  47.03 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  47.09 
 
 		 194 aa  147  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  46.74 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  53.37 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  49.72 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  49.17 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  47.78 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  46.41 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  45.7 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  48.11 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  46.45 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  48.11 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  46.7 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  51.16 
 
 		 209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.58 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  45.6 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  51.06 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  51.06 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  44.32 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  43.82 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  49.44 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  51.67 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  48.65 
 
 		 196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  43.41 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  51.11 
 
 		 281 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  47.85 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 		 201 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  46.7 
 
 		 189 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  45.66 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  46.41 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  45.41 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  46.28 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.11 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>