More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0053 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  88.17 
 
 		 186 aa  338  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  88.17 
 
 		 186 aa  338  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  88.17 
 
 		 186 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  87.63 
 
 		 186 aa  334  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  84.86 
 
 		 186 aa  320  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  83.87 
 
 		 186 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  83.87 
 
 		 186 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  81.72 
 
 		 186 aa  317  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  82.7 
 
 		 205 aa  312  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  81.08 
 
 		 185 aa  309  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  81.08 
 
 		 185 aa  309  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  81.08 
 
 		 185 aa  309  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  81.08 
 
 		 185 aa  309  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  81.08 
 
 		 185 aa  309  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  81.62 
 
 		 186 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  80.54 
 
 		 185 aa  307  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  80.54 
 
 		 201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  80.54 
 
 		 201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  73.22 
 
 		 192 aa  279  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  73.77 
 
 		 188 aa  278  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  73.12 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  68.11 
 
 		 188 aa  274  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  67.93 
 
 		 184 aa  273  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  69.44 
 
 		 189 aa  261  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  67.6 
 
 		 235 aa  251  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  65.05 
 
 		 191 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  68.07 
 
 		 183 aa  234  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  64.84 
 
 		 184 aa  224  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  59.89 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  62.64 
 
 		 187 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  85.94 
 
 		 129 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  55.91 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  56.45 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.08 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  51.38 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  50.83 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  47.46 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  46.37 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  48.85 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  39.55 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.23 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.38 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.23 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 188 aa  120  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.04 
 
 		 189 aa  121  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.32 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.14 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.14 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.81 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.47 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.59 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  38.46 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.01 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.22 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  41.67 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.22 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  39.67 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.41 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  39.18 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.2 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  39.18 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.16 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.5 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.11 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.57 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.57 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.57 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  36.84 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.2 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  48.28 
 
 		 120 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.22 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  41.21 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  39.47 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.78 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  37.3 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.87 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.87 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>