More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6187 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  92.43 
 
 		 186 aa  345  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  89.19 
 
 		 201 aa  335  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  89.19 
 
 		 201 aa  335  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  88.17 
 
 		 186 aa  334  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  88.17 
 
 		 186 aa  334  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  88.17 
 
 		 186 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  88.17 
 
 		 186 aa  333  7e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  87.57 
 
 		 186 aa  330  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  85.95 
 
 		 185 aa  328  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  85.95 
 
 		 185 aa  328  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  85.95 
 
 		 185 aa  328  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  85.95 
 
 		 185 aa  328  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  85.41 
 
 		 185 aa  326  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  84.86 
 
 		 185 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  84.41 
 
 		 186 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  84.41 
 
 		 186 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  84.32 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  81.72 
 
 		 186 aa  317  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  81.72 
 
 		 186 aa  317  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  74.19 
 
 		 188 aa  280  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  74.32 
 
 		 188 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  75.98 
 
 		 189 aa  277  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  69.02 
 
 		 184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  72.78 
 
 		 235 aa  270  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  69.4 
 
 		 192 aa  267  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  67.93 
 
 		 188 aa  265  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  75.9 
 
 		 183 aa  254  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  62.37 
 
 		 191 aa  243  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  66.84 
 
 		 200 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  89.06 
 
 		 129 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  58.06 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  64.84 
 
 		 184 aa  225  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  60.99 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.08 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  53.51 
 
 		 192 aa  201  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  53.3 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  53.04 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  48.04 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  45.2 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  43.89 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  46.56 
 
 		 137 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.78 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 189 aa  124  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.92 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  43.45 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  43.45 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.66 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  39.43 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.76 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  39.43 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.34 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.96 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  37.84 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  39.56 
 
 		 228 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  38.42 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.12 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  38.5 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  40.32 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.44 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.56 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.82 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.46 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.13 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  39.46 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.56 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.33 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.61 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.56 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.9 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.87 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.9 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  39.47 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>