More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2319 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  100 
 
 
137 aa  278  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  55.3 
 
 
183 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  48.85 
 
 
186 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  48.85 
 
 
186 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  48.51 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
184 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  47.33 
 
 
192 aa  127  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
185 aa  127  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  45.8 
 
 
186 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
201 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
201 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  45.8 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  45.8 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  45.8 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  45.8 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  45.8 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  45.8 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  45.8 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  45.8 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  45.8 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  46.56 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  45.04 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  46.56 
 
 
188 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  45.8 
 
 
205 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  45.04 
 
 
186 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  45.04 
 
 
186 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  48.09 
 
 
188 aa  123  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  44.12 
 
 
188 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  46.92 
 
 
187 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  47.45 
 
 
188 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  47.33 
 
 
183 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  49.62 
 
 
235 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  47.06 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  48.85 
 
 
188 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  48.85 
 
 
188 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  50.4 
 
 
128 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  48 
 
 
188 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  48 
 
 
188 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  41.43 
 
 
192 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  45.32 
 
 
190 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  48.51 
 
 
191 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  46.32 
 
 
186 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  44.85 
 
 
207 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  44.53 
 
 
189 aa  105  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  44.7 
 
 
190 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  46.21 
 
 
185 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  47.76 
 
 
185 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  46.03 
 
 
184 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  44.36 
 
 
203 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  53.95 
 
 
187 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  45.38 
 
 
200 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 
180 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  43.88 
 
 
184 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0986  resolvase-like protein  54.88 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  40.58 
 
 
184 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  43.41 
 
 
205 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  43.41 
 
 
205 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 
185 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  39.69 
 
 
187 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  40.74 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  40.74 
 
 
185 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 
185 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  39.29 
 
 
154 aa  90.5  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  39.71 
 
 
183 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  40.91 
 
 
205 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  37.88 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  42.42 
 
 
186 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
185 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  38.97 
 
 
185 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  43.31 
 
 
183 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.81 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.3 
 
 
196 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 
186 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  37.12 
 
 
186 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  40.59 
 
 
194 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 
186 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  38.28 
 
 
196 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  40.94 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  39.1 
 
 
198 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.43 
 
 
203 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  37.4 
 
 
290 aa  80.5  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  32.59 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  38.35 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  36.36 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  36.36 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.88 
 
 
203 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 
313 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  34.59 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  34.71 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  34.31 
 
 
198 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.07 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  34.13 
 
 
214 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.38 
 
 
194 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.38 
 
 
194 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  34.15 
 
 
185 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>