More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1312 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  93.41 
 
 		 184 aa  322  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  70.49 
 
 		 191 aa  280  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  68.13 
 
 		 184 aa  261  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  63.19 
 
 		 186 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  63.19 
 
 		 186 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  62.64 
 
 		 186 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  62.64 
 
 		 186 aa  241  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  62.64 
 
 		 186 aa  242  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  63.74 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  63.19 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  60.99 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  61.54 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  61.54 
 
 		 186 aa  237  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  61.54 
 
 		 186 aa  237  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  62.64 
 
 		 185 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  61.54 
 
 		 186 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  62.16 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  61.54 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  61.54 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  60.44 
 
 		 186 aa  233  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  62.09 
 
 		 188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  57.61 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  59.32 
 
 		 189 aa  221  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  59.89 
 
 		 192 aa  221  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  59.89 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  56.91 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  54.26 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  58.38 
 
 		 200 aa  207  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  54.64 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  57.32 
 
 		 183 aa  194  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  55.14 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  54.59 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  62.6 
 
 		 129 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  43.78 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  44.38 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  39.46 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  39.46 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.91 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  42.22 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  38.2 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  39.78 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.59 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.38 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.67 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  40 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.22 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.67 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  45.11 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.64 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  40.76 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.78 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  41.99 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.16 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  39.57 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  39.57 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.33 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  38.67 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.61 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.89 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.64 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  46.53 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  46.53 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.84 
 
 		 205 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  35.52 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.98 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.56 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.56 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.56 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  38.17 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  38.17 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  38.17 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 313 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>