More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2179 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  50 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  42.77 
 
 		 184 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.66 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  40.22 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  46.53 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  39.43 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  42.13 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  41.85 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  39.18 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  39.18 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  39.18 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  37.89 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  39.05 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  39.18 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  39.18 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  43.97 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  43.97 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.64 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  38.12 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.17 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  41.84 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  39.33 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  41.96 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  41.96 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.97 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.91 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  48 
 
 		 137 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  40.43 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.07 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  37.91 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  37.91 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  35.26 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  47.83 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.77 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  47.06 
 
 		 128 aa  104  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  38.67 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.13 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  40.1 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  41.18 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  35.2 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  41.86 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  34.59 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.78 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  42.14 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  36.81 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  34.59 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  46.03 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  32.8 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  34.81 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  35.48 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  31.89 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  33.7 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  44.44 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  32.98 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  33.68 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  34.41 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  32.64 
 
 		 198 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  32.65 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  32.07 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  37.32 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  29.57 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  32.28 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  45.56 
 
 		 129 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  33.14 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  32.98 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.43 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  32.09 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  30.51 
 
 		 189 aa  84.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>