More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1006 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  67.96 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  65.03 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  65.03 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  64.64 
 
 		 184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  63.54 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  58.76 
 
 		 186 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  54.64 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  54.1 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  53.26 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  53.26 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  51.67 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  51.12 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  51.41 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  50.84 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  52.25 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  46.63 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  54.61 
 
 		 154 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.61 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.05 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  42.86 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.48 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  45.98 
 
 		 198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  44 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  46.29 
 
 		 196 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  45.98 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  46.29 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  46.29 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  46.41 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.91 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  47.73 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  47.16 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  47.16 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 		 199 aa  141  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  44.32 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 201 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  42.47 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  47.16 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.57 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  40.22 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  47.43 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  41.85 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.77 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.77 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  42.05 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  45.45 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.33 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.29 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.29 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  44.94 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.98 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.61 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.71 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.57 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.22 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.22 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  40.22 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  39.46 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  39.13 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  40.34 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.89 
 
 		 203 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  39.55 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  41.11 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  43.16 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  39.46 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.13 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 324 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.5 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.5 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  40.68 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  43.75 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>