More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6405 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  96.22 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  96.22 
 
 		 185 aa  357  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  85.64 
 
 		 185 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  69.61 
 
 		 183 aa  248  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  68.65 
 
 		 183 aa  246  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  69.23 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  64.44 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  64.64 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  64.64 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  64.64 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  54.7 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  54.14 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  51.35 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  49.72 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  50.84 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 		 290 aa  161  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 313 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  45.41 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  46.74 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  44.86 
 
 		 206 aa  147  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  44.86 
 
 		 206 aa  147  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  46.63 
 
 		 190 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  46.41 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  44.86 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  47.73 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  47.51 
 
 		 205 aa  140  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  42.31 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  45.3 
 
 		 203 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  47.14 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.44 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.44 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  43.26 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  42.16 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  42.33 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  43.82 
 
 		 186 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.88 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.71 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.78 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  42.41 
 
 		 224 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.83 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  40.88 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  40.57 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40.56 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  46.53 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  40.68 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  45.73 
 
 		 305 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  40 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.11 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.08 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  48.94 
 
 		 293 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.87 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  46.1 
 
 		 293 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.43 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.54 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.54 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.54 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  40.31 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.3 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.89 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.89 
 
 		 309 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.43 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.43 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  45.39 
 
 		 293 aa  111  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  45.39 
 
 		 326 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>