More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0938 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  100 
 
 
154 aa  300  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  93.59 
 
 
187 aa  276  9e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  64.9 
 
 
186 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  63.45 
 
 
191 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  62.76 
 
 
203 aa  175  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  61.38 
 
 
185 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  59.72 
 
 
190 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  55.8 
 
 
190 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  58.99 
 
 
185 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  54.61 
 
 
189 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  52.67 
 
 
185 aa  150  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  54.86 
 
 
205 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  54.86 
 
 
205 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  51.75 
 
 
185 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  54.01 
 
 
184 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  50.68 
 
 
186 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  50.7 
 
 
205 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  50.71 
 
 
180 aa  120  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  45.71 
 
 
186 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  46.1 
 
 
183 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  45 
 
 
186 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  45 
 
 
186 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  45 
 
 
186 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  45.33 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  46.53 
 
 
183 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  43.33 
 
 
198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  41.1 
 
 
188 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 
185 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.86 
 
 
191 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  42.96 
 
 
185 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  42.75 
 
 
185 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  43.18 
 
 
183 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  40.85 
 
 
201 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  40.85 
 
 
201 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  42.75 
 
 
185 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 
186 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
190 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  40.82 
 
 
198 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  39.16 
 
 
192 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  42.03 
 
 
197 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 
187 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
192 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.55 
 
 
182 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  38.51 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.19 
 
 
188 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 
201 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  42.86 
 
 
186 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  42.86 
 
 
186 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.33 
 
 
185 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.33 
 
 
185 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
206 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
206 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  45.07 
 
 
194 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 
191 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.3 
 
 
191 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  48.78 
 
 
181 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  40.71 
 
 
180 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 
196 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  38.73 
 
 
186 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5141  resolvase domain-containing protein  51.61 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748263  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  38.03 
 
 
186 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.91 
 
 
188 aa  97.1  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 
209 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  38.03 
 
 
186 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  41.13 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  38.13 
 
 
192 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  38.13 
 
 
197 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.33 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.33 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.33 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  38.13 
 
 
197 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  46.1 
 
 
184 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  38.13 
 
 
197 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
196 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  38.97 
 
 
189 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.07 
 
 
185 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  40.82 
 
 
188 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  38.97 
 
 
189 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 
199 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.25 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  41.13 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  39.1 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  40.41 
 
 
188 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  38.19 
 
 
186 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.25 
 
 
186 aa  94.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.67 
 
 
188 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.32 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  38.26 
 
 
207 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  38.3 
 
 
183 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  40.58 
 
 
197 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.67 
 
 
218 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.89 
 
 
186 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.89 
 
 
186 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
195 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  38.89 
 
 
186 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.22 
 
 
188 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 
191 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>