More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5397 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  85.33 
 
 		 185 aa  322  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  85.33 
 
 		 185 aa  320  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  85.64 
 
 		 185 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  70 
 
 		 183 aa  245  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  68.65 
 
 		 184 aa  241  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  67.22 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  64.64 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  62.98 
 
 		 186 aa  227  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  62.98 
 
 		 186 aa  227  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  62.98 
 
 		 186 aa  227  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  53.59 
 
 		 196 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  52.22 
 
 		 197 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  52.22 
 
 		 198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  46.11 
 
 		 290 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 313 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  43.26 
 
 		 198 aa  147  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  45.86 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  44.75 
 
 		 190 aa  141  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  44.39 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  43.24 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.21 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  44.75 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.2 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.2 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  46.43 
 
 		 140 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  43.75 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  43.96 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  42.41 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  41.21 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  42.54 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  38.92 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.89 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.88 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.46 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.89 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  49.65 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  39.13 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  48.91 
 
 		 305 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  38.98 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.33 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.12 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  44.6 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  41.01 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  38.38 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.31 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  42.47 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 		 293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  45.26 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 		 326 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.04 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.46 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.96 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.04 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  38.38 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 224 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  43.31 
 
 		 293 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  38.5 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  37.08 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>