More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2096 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  52.75 
 
 		 203 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  48.33 
 
 		 188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.87 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  59.29 
 
 		 163 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  45.56 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  47.51 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 189 aa  151  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.11 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0718  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.784479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.67 
 
 		 182 aa  147  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  49.68 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  49.37 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  49.37 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  43.58 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2399  resolvase domain-containing protein  48.07 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  44.77 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  52.55 
 
 		 293 aa  138  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.63 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  50.79 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  53.38 
 
 		 298 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  53.38 
 
 		 293 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  53.38 
 
 		 326 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3594  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.00636554 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  42.47 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.39 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  42.44 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 		 307 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 		 307 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.39 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  51.13 
 
 		 293 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  51.88 
 
 		 293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  53.6 
 
 		 294 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  49.01 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  53.6 
 
 		 294 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  42.22 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  38.46 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  38.46 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.86 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  36.26 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  38.59 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  43.4 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  43.71 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  47.95 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.38 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  40.22 
 
 		 309 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.8 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  46.04 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  39.68 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  45.68 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  43.02 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  43.02 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  45.68 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  49.62 
 
 		 324 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  42.14 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  43.62 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  46.04 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  40.78 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0846  Resolvase domain protein  44.51 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  42.61 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  42.86 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  42.86 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  42.55 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  41.4 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  46.67 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  46.67 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  39.55 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  39.58 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  42.13 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>