More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1735 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  99.47 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  57.54 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  58.1 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  55.31 
 
 		 191 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  54.14 
 
 		 186 aa  197  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  52.75 
 
 		 186 aa  197  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  56.52 
 
 		 184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  53.59 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  53.04 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  53.04 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  53.59 
 
 		 188 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  54.59 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  52.49 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  52.49 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  52.49 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.65 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  51.93 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  51.35 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  51.93 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  51.93 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  49.46 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  49.46 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  50.83 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  50.83 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  53.23 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  47.54 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  49.72 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  50.83 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  52.73 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  46.7 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  56.45 
 
 		 129 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  44.62 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  48.85 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  39.89 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.89 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  39.34 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  37.7 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.2 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.08 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.75 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.33 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  37.57 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  36.26 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36.07 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.76 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.1 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  39.47 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  37.1 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.25 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  37.37 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  38.95 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.07 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.16 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  39.49 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  39.49 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.16 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  36.76 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  33.51 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  37.43 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  37.17 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  36.07 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  35.76 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  32.46 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  33.51 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  29.63 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  35.86 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  35.86 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>