More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25710 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  78.84 
 
 		 197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  71.05 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  71.43 
 
 		 209 aa  275  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  70.68 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  69.63 
 
 		 194 aa  265  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  62.23 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  62.23 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  62.23 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  66.41 
 
 		 147 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  40.76 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.38 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.27 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.99 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  47.06 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  41.8 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  41.8 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.87 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.89 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.38 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.43 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.31 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.89 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.18 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.66 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.54 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  37.5 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  39.13 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  39.13 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  39.13 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.17 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  36.22 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.87 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.43 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.43 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.23 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.23 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.64 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  34.43 
 
 		 181 aa  111  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  40.32 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  34.59 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.02 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.87 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.02 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  37.43 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  37.11 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.43 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  38.86 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.65 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.79 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  40.45 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  37.17 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.99 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.76 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  42.67 
 
 		 184 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.76 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  38.38 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  36.65 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  38.71 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.57 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  40.54 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  40.54 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  39.67 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  33.52 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>