280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6912 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  83.22 
 
 		 227 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  61.49 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  63.33 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  56.88 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  62.76 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  55.86 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  57.79 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  59.59 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  58.62 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  59.31 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  55.13 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  51.72 
 
 		 224 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  64.43 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  57.45 
 
 		 216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  54.36 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  62.58 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  49.65 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  52.67 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  50.67 
 
 		 231 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  64.83 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  60.28 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  48.78 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  41.9 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  47.95 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  48.92 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  47.26 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  46.85 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  43.48 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  47.47 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  46.03 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  43.87 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  41.01 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  41.13 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  45.51 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  45.19 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  40.29 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  40.62 
 
 		 198 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  37.32 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 		 380 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  39.1 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.22 
 
 		 182 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  37.58 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  37.95 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  34.51 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  37.75 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  37.75 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.14 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.97 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  35.4 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.45 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  38.39 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  38.39 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  38.39 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  36.73 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.6 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.72 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  31.87 
 
 		 474 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.18 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  35.97 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.93 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  43.81 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  32.91 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  36.91 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  34.32 
 
 		 522 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  38.06 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  38.06 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  38.06 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  32.72 
 
 		 534 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.5 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  32.72 
 
 		 534 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  31.87 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  32 
 
 		 528 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  32 
 
 		 528 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  38.06 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  31.21 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.67 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.26 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  32.72 
 
 		 534 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  28.91 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  29.11 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  32.12 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.09 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  32.37 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.91 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.53 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.53 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  31.29 
 
 		 532 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.5 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>