More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7746 on replicon NC_011888
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  52.75 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  48.87 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  48.83 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  47.51 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  46.15 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  45.29 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  52.53 
 
 		 226 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  48.39 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  45.25 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  47.27 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  43.12 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  45.62 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  40.09 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  51.85 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  60.27 
 
 		 243 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  44.93 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.12 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  51.15 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  45.78 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  44.34 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  46.82 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  40.19 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  44.8 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  41.63 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  47.09 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  41.04 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 269 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  43.05 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  42.05 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  46.81 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  46.3 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  37.12 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  36.2 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  36.94 
 
 		 380 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  33.62 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  30.34 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  32.05 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  35.58 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  29.83 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  32.9 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  36.6 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.33 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.48 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  35.48 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.57 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.81 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.5 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  41.11 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.01 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  38.14 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  32.19 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  30.84 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  32.52 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.82 
 
 		 295 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  32.35 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  33.14 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  33.55 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  30.92 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  33 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  33.97 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.06 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  31.45 
 
 		 534 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.66 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  30.52 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  35.09 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  30.82 
 
 		 537 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  33.83 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31.36 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  32.65 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  32.65 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  30.95 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  29.78 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  31.1 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.16 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  30.23 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  33.33 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>