More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4374 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  48.06 
 
 
227 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  46.63 
 
 
215 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  49.3 
 
 
231 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  47.39 
 
 
229 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  45.77 
 
 
380 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  45.23 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 
283 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  38.89 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  38.79 
 
 
295 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  36 
 
 
525 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  40.22 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  40.22 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  33.64 
 
 
462 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  34.47 
 
 
522 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  33.77 
 
 
228 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.25 
 
 
462 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.93 
 
 
515 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  33.18 
 
 
462 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  33.17 
 
 
343 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 
187 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 
445 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 
445 aa  88.6  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  35.24 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.54 
 
 
415 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  30.59 
 
 
459 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  32.04 
 
 
489 aa  86.3  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  30.88 
 
 
522 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.22 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.22 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.22 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  32.08 
 
 
412 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  33.12 
 
 
500 aa  85.5  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.03 
 
 
544 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  33.33 
 
 
449 aa  85.1  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.84 
 
 
485 aa  84.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.15 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  33.15 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  33.15 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  33.15 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  33.15 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.15 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  33.15 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  39.22 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  33.15 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  35.58 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.96 
 
 
188 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  45.19 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  33.17 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  36.36 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  29.05 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  37.83 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  33.13 
 
 
528 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  33.13 
 
 
528 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 
568 aa  82  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.42 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  38.56 
 
 
185 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  37.4 
 
 
460 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.35 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.85 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.85 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  32.11 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.07 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  32.63 
 
 
537 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.42 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  35.81 
 
 
527 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  43.23 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  35.68 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  33.76 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.85 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  37.04 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  36.11 
 
 
532 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.72 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  36.65 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.03 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  35.8 
 
 
201 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.88 
 
 
185 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  36.56 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.07 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.88 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  36.59 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  34.64 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.88 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  39.49 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
281 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  40.13 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  34.42 
 
 
443 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  35.95 
 
 
550 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  37.09 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  32.7 
 
 
549 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.01 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>