More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2472 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  51.87 
 
 
217 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  48.9 
 
 
228 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  44.3 
 
 
228 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  50.49 
 
 
216 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  49.78 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 
224 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  47.95 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  47.88 
 
 
236 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  45.33 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  51.75 
 
 
224 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  52.19 
 
 
225 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  44.54 
 
 
233 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  43.1 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  48.48 
 
 
227 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  42.67 
 
 
229 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  43.91 
 
 
231 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  46.22 
 
 
234 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  44.04 
 
 
268 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  39.44 
 
 
219 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  55.13 
 
 
243 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  40.64 
 
 
216 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  42.79 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  41.96 
 
 
231 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.24 
 
 
223 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  37.65 
 
 
269 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  45.89 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  40.6 
 
 
248 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  47.48 
 
 
236 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  40.86 
 
 
211 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  38.38 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  39.3 
 
 
198 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  54.48 
 
 
227 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  36.89 
 
 
380 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  34.02 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  32.33 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  38.14 
 
 
231 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5214  hypothetical protein  53.33 
 
 
117 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333892  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  42.86 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  32.52 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  39.07 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  30.17 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  30.99 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  29.82 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  31.18 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.67 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  36 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  35.48 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  33.52 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.32 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  26.94 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 
192 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.51 
 
 
513 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.01 
 
 
462 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  27.31 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  35.95 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  36.42 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  32.93 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  32.93 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  32.93 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  31.49 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  31.49 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
515 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  33.75 
 
 
188 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  32.77 
 
 
191 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  31.87 
 
 
313 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
185 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.68 
 
 
194 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
185 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
185 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
185 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.71 
 
 
192 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.71 
 
 
192 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.61 
 
 
189 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.89 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  27.64 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  30.34 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  30.46 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
185 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.11 
 
 
522 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.78 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.78 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  29.78 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.87 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  30.34 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.45 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.45 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  32.45 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  31.25 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  31.25 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.62 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  32.28 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  30.43 
 
 
474 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  32.95 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  29.53 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  30.85 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>