217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8420 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  100 
 
 		 227 aa  430  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  54.82 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  50 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  53.15 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  58.64 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  52.94 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  46.15 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  50.45 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  42.92 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  57.33 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  47.69 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  49.33 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  48.89 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  45.95 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  49.78 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  64.38 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  54.75 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  48.9 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  46.72 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  42.98 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  54.48 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  52.86 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  44.49 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  45.25 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  41.1 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  35.78 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  36.22 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  41.52 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  35.14 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  36.24 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  46.21 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  38.36 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  35.04 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  42.42 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  33.2 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  33.33 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.74 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  35.32 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 		 380 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 189 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  34.9 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  39.47 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.97 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.11 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.73 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.7 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  39.73 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  39.1 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  39.04 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.48 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.04 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  32.74 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  35.12 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  35.12 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  35.12 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  34.03 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  32.93 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  37.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.87 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.57 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.62 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.25 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.25 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.25 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.36 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.23 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  37.86 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  32.37 
 
 		 474 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  38.62 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  37.8 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  37.67 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  36 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  35.62 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.04 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.04 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.89 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  30.68 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  30.68 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  39.81 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.84 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.54 
 
 		 462 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  35.85 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  26.83 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.9 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>