More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1741 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  58.04 
 
 		 224 aa  265  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  58.56 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  53.95 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  52.27 
 
 		 216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  49.56 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  53.33 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  48.87 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  49.35 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  48.47 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  48.03 
 
 		 229 aa  187  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  46.36 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  52.44 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  44.3 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  49.78 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  49.78 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  44.05 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  39.18 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  55.86 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  41.74 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  40.25 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  42.22 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  45.19 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  42.15 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  45.74 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  40.44 
 
 		 248 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.29 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  43.11 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  43.54 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  35.34 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  37.57 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  44.8 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  35.32 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  36.17 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  35.15 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.83 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.65 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  33.77 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.44 
 
 		 462 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  31.74 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  38.06 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  30.67 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.04 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  37.09 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  37.09 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  29.92 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  32.31 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.78 
 
 		 542 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.78 
 
 		 542 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.78 
 
 		 542 aa  75.9  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  29.87 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.74 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.82 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.31 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.54 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  34.38 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  35.62 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.42 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.36 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.34 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  35.9 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  34.55 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.76 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.85 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  32.93 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.76 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.76 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.71 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  30.81 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  41.44 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  35.59 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  37.28 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.54 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.16 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  28.95 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.26 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  33.73 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.26 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  42.37 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.49 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.62 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.82 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  31.64 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  33.55 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  33.55 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  33.55 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  37.34 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.84 
 
 		 515 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  35.19 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>