More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4956 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  54.82 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  49.56 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  53.95 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  58.26 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  50.68 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  58.52 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  47.16 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  50.87 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  50.43 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  50.21 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  57.46 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  48.65 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  50.21 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  51.74 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  43.81 
 
 		 219 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  47.88 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  63.33 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  42.91 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  45.45 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  48.73 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  43.56 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  48.07 
 
 		 226 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  42.54 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  53.95 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  43.69 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  44.35 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  36.59 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.1 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  36.99 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  36.64 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  37.66 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  37.44 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  34.63 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  33.05 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  40.61 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  35.9 
 
 		 211 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.71 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.99 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.99 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  34.93 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.26 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.91 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.74 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.48 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.26 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.54 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.54 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.91 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  32.16 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  32.33 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.49 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.11 
 
 		 665 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.5 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  33.33 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.58 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  30.3 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  36.91 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  36.91 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  38.56 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.19 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  28.51 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  34.87 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  38.56 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  32.75 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  36.54 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  32.9 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  33.55 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  34.94 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  35.1 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5214  hypothetical protein  42.45 
 
 		 117 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  29.18 
 
 		 613 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.56 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  31.4 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  31.4 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  37.18 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  36.49 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  34.9 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  33.55 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.48 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.49 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.74 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.14 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  28.99 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.21 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  34.9 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.33 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  29.18 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.75 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  34.25 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  36.05 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  29.58 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  34.46 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>