244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4152 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  70.09 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  56.88 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  62.27 
 
 		 223 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  47.73 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  44.8 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  43.11 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  42.92 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  44.35 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  41.52 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  41.67 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  43.69 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  41.23 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  39.81 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  43.89 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  41.18 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  42.67 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  39.64 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  47.53 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  40.52 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  40.52 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  47.53 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  41.78 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  40.5 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  39.91 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  45.08 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  46.22 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  39.8 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  38.79 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  40.47 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  47.95 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  39.73 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  39.57 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  36.02 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.26 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  38.99 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  33.84 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.75 
 
 		 542 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.75 
 
 		 542 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.75 
 
 		 542 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  38.31 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  41.07 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5214  hypothetical protein  47.87 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.63 
 
 		 380 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.71 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.81 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  27.9 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  29.03 
 
 		 565 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.38 
 
 		 540 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.41 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.18 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.24 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.75 
 
 		 551 aa  62.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.58 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  25.65 
 
 		 535 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.93 
 
 		 665 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 590 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25.21 
 
 		 580 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.08 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.39 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  33.52 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  30.17 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  30.94 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  29.01 
 
 		 542 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.82 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.66 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  32.26 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.46 
 
 		 485 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  29.03 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  29.2 
 
 		 613 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  35.57 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 		 521 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 		 579 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  28.03 
 
 		 513 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.9 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.78 
 
 		 561 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.67 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  32.47 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 525 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  30.15 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  31.41 
 
 		 603 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  30.68 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  34.57 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  27.92 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31.68 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  33.95 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  28.96 
 
 		 539 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.67 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  30 
 
 		 526 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  28.83 
 
 		 546 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>