183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0737 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  100 
 
 
542 aa  1121    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  54.99 
 
 
526 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  47.9 
 
 
539 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  48.21 
 
 
524 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  27.78 
 
 
524 aa  120  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.34 
 
 
513 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.22 
 
 
542 aa  107  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 
542 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 
542 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  21.26 
 
 
549 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  24.54 
 
 
493 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.65 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  23.55 
 
 
743 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  24.22 
 
 
516 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.33 
 
 
522 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.28 
 
 
546 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  23.55 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.86 
 
 
515 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  23.73 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.39 
 
 
537 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  22.4 
 
 
568 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.63 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  22.34 
 
 
525 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.6 
 
 
534 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.63 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.42 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.42 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.99 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.56 
 
 
561 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.71 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.6 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.6 
 
 
534 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.6 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
534 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.57 
 
 
558 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
534 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.44 
 
 
547 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
537 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.7 
 
 
537 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.13 
 
 
540 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  26.88 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.62 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.64 
 
 
551 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.1 
 
 
511 aa  73.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  23.41 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.77 
 
 
509 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 
517 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.17 
 
 
504 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.9 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.88 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.88 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.54 
 
 
613 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.25 
 
 
546 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.85 
 
 
510 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.66 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  23.98 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  22.78 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0853  DNA recombinase, putative  22.71 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000111674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.48 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  23.08 
 
 
544 aa  67  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0849  DNA recombinase, putative  22.42 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.88 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.75 
 
 
525 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  22.92 
 
 
550 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 
555 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  20.72 
 
 
519 aa  64.7  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  20.79 
 
 
504 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  24.1 
 
 
564 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.13 
 
 
546 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.4 
 
 
475 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  22.1 
 
 
441 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.28 
 
 
447 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  24.62 
 
 
607 aa  62.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  29.41 
 
 
214 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.78 
 
 
521 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  21.28 
 
 
444 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.49 
 
 
462 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  22.1 
 
 
441 aa  60.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.59 
 
 
485 aa  60.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.74 
 
 
465 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  24.58 
 
 
532 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  23.5 
 
 
543 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  21.45 
 
 
555 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.04 
 
 
527 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  25.07 
 
 
460 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  23.5 
 
 
543 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  25.15 
 
 
441 aa  58.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  20.17 
 
 
479 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.51 
 
 
529 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  23.45 
 
 
568 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.56 
 
 
515 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.75 
 
 
665 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  31.48 
 
 
206 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  22.55 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  22.24 
 
 
537 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23 
 
 
535 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.66 
 
 
500 aa  54.3  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.29 
 
 
443 aa  53.9  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25 
 
 
525 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>