47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6343 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  100 
 
 		 211 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  40.69 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  40.2 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  41.04 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  36.41 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  35.15 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  39.78 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  43.12 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  39.13 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  36.41 
 
 		 221 aa  97.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  35.9 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  34.16 
 
 		 268 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  31.88 
 
 		 219 aa  92  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  34.54 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  34.57 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  31.66 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  33.98 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  32.32 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  41.21 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  37.24 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  36.75 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  45.19 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  38.24 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  34.34 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  39.05 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  42.57 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5214  hypothetical protein  38.39 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40.74 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  32.02 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  26.98 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  26.7 
 
 		 264 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  31.21 
 
 		 380 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  29.03 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  25.56 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  27.1 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  24.06 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  33.91 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  31.73 
 
 		 189 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  32.14 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>