More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1037 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
504 aa  1043    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1010  resolvase-like protein  97 
 
 
322 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.204913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.88 
 
 
546 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  28.61 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  29.1 
 
 
542 aa  153  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  29.1 
 
 
554 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25 
 
 
462 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.22 
 
 
546 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 
485 aa  143  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 
521 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.45 
 
 
475 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.77 
 
 
506 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.47 
 
 
510 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.38 
 
 
517 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  27.73 
 
 
641 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  29.23 
 
 
484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  29.23 
 
 
484 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.72 
 
 
542 aa  124  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.72 
 
 
542 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.72 
 
 
542 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1228  hypothetical protein  96.67 
 
 
60 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00194164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.27 
 
 
515 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  27.02 
 
 
505 aa  120  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1046  hypothetical protein  94.92 
 
 
79 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.48 
 
 
485 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.83 
 
 
515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28 
 
 
613 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.53 
 
 
534 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.96 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.33 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
537 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
534 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.53 
 
 
534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.53 
 
 
534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  28.05 
 
 
527 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.32 
 
 
509 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.53 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.64 
 
 
546 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  27.76 
 
 
460 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.2 
 
 
415 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
513 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.54 
 
 
665 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.89 
 
 
522 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  28.62 
 
 
626 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.1 
 
 
496 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.46 
 
 
563 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.18 
 
 
540 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  27.56 
 
 
525 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.69 
 
 
525 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25 
 
 
547 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.11 
 
 
522 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
576 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 
474 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 
445 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 
522 aa  104  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.12 
 
 
445 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.48 
 
 
441 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  25.06 
 
 
476 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  28.08 
 
 
544 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.88 
 
 
549 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  28.98 
 
 
513 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.39 
 
 
553 aa  101  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.48 
 
 
441 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.78 
 
 
534 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 
445 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 
537 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  29.48 
 
 
500 aa  99.8  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.35 
 
 
429 aa  99.8  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.21 
 
 
558 aa  99.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.77 
 
 
441 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 
564 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.93 
 
 
561 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.55 
 
 
528 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.55 
 
 
528 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  27.69 
 
 
443 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.64 
 
 
558 aa  97.1  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.49 
 
 
489 aa  97.1  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.13 
 
 
579 aa  96.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.37 
 
 
519 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  24.21 
 
 
531 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.03 
 
 
539 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 
551 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.04 
 
 
537 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.57 
 
 
662 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  27.18 
 
 
540 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.06 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25.57 
 
 
580 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 
511 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.25 
 
 
565 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  24.7 
 
 
542 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.2 
 
 
519 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  26.65 
 
 
539 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.39 
 
 
521 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.13 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  26.04 
 
 
421 aa  91.3  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.46 
 
 
546 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.43 
 
 
482 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.9 
 
 
515 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>