More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0923 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  55.65 
 
 		 228 aa  235  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  53.42 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  53.04 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  51.74 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  49.35 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  52 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  48.72 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 		 269 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  48.26 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  58.26 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  48.9 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  48.73 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  44.83 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  44.83 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  45.78 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  49.57 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  46.58 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  39.21 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  43.72 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  45.81 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  41.45 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  38.6 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  42.79 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  38.79 
 
 		 216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  49.35 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  35.78 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  39.91 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  35.12 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  36.18 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  34.62 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.82 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  53.33 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  34.57 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  43.23 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  33.9 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  33.19 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  37.45 
 
 		 380 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  38.16 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  36.81 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  36.81 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  36.81 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  35.4 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.05 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  36.67 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.42 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.42 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 150 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  30.6 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.87 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.28 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  33.55 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  29.57 
 
 		 613 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  33.19 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  32.9 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  34.21 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.67 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  30.83 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  31.32 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  31.32 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.39 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.46 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  32.5 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  29.74 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  34.18 
 
 		 187 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.59 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  32.7 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  34.27 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  34.03 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  32.07 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  37.01 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.18 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.03 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.86 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  36.24 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  35.76 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34.67 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  33.52 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  32.86 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  30.77 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  34.64 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  33.12 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  33.12 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.5 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  36.61 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  32.7 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.9 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>