More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3423 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  86.49 
 
 		 212 aa  324  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  71.12 
 
 		 192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  65.59 
 
 		 217 aa  235  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  52.78 
 
 		 191 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  51.11 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  51.67 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  52.22 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  51.11 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  51.11 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  49.44 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  49.44 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  49.44 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  44.75 
 
 		 196 aa  164  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  44.2 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  44.2 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  44.2 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  44.2 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  44.2 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  44.2 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  44.2 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  47.22 
 
 		 222 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  45.65 
 
 		 189 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  46.74 
 
 		 190 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  45.65 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  42.39 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  43.41 
 
 		 318 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  44.51 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  40 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  39.57 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  35.16 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  41.85 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  41.85 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  41.85 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  40.76 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.52 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.84 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  34.25 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  40.11 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  38.81 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  44.37 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.42 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.42 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.68 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  44 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.08 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.89 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  37.7 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.76 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  33.86 
 
 		 196 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  38.04 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  32.61 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.46 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.63 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.63 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.63 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  38.04 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 307 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 307 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.61 
 
 		 235 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  33.51 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  32.8 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.33 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  38.8 
 
 		 219 aa  97.8  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  39.13 
 
 		 210 aa  97.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  36.07 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  46.88 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  32.24 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>