More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4794 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  41.97 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  42.19 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  41.33 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  42.71 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  41.29 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  39.58 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  36.92 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  37.31 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  38.66 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  39.38 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  38.14 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  38.14 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  37.95 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  37.7 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  36.84 
 
 		 318 aa  94.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.75 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  36.79 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  33.83 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  33.83 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  33.83 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  33.16 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  38.14 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  33.16 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.16 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.18 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  36.6 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  32.65 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.18 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.65 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.67 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.95 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  35.75 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  35.75 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  31.41 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  39.1 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.85 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  32.8 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.95 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  32.63 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  36.36 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  36.36 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  32.83 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31.77 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  36.36 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  38.89 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  34.21 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  33.67 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  33.51 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.98 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  38.51 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  32.45 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  32.91 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  32.8 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  38.1 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  34.54 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  31.44 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  33.51 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  33.51 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  35.75 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  39.2 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.81 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  33.86 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1543  resolvase domain-containing protein  35.25 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0184299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  33.08 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.45 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.71 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  33.33 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  33.33 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  33.33 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  34.33 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.35 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  33.58 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  28.21 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  27.55 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  35.76 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  35.76 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  35.76 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  33.51 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.11 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.64 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>