More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003898 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  60.11 
 
 		 190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  54.87 
 
 		 318 aa  215  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  56.22 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  55.68 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  44.92 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  43.01 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  43.32 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  43.32 
 
 		 191 aa  151  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  43.39 
 
 		 192 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  41.97 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  41.97 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  43.39 
 
 		 192 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  42.49 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  40.72 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  44.26 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  42.39 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  38.95 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  38.95 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  38.95 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  38.95 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  38.95 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  38.42 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  38.42 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  38.42 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  38.42 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  39.57 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  41.8 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  38.54 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  41.33 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  41.3 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.51 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.04 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  35.98 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 183 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  34.16 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  34.16 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  38.3 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.67 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  35.14 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 307 aa  95.9  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 307 aa  95.9  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  35.23 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  33.68 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  35.57 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.57 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  34.97 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  38.75 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  36.46 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  35.87 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  35.75 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  35.75 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.81 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.07 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  35.29 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.7 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 185 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.87 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  35.08 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  34.43 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  36.61 
 
 		 309 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  34.97 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  35.87 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  35.08 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.57 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 159 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.22 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.48 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  34.55 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  40.32 
 
 		 186 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  34.54 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  33.89 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  32.64 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.5 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.5 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  33.15 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  35.14 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  35.14 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>