More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2374 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  93.68 
 
 		 191 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  88.48 
 
 		 192 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  87.37 
 
 		 191 aa  333  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  86.39 
 
 		 222 aa  329  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  85.26 
 
 		 193 aa  327  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  85.34 
 
 		 191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  70.68 
 
 		 193 aa  269  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  64.55 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  64.55 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  65.08 
 
 		 197 aa  254  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 		 194 aa  251  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  63.87 
 
 		 198 aa  247  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  57.98 
 
 		 196 aa  231  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  57.98 
 
 		 196 aa  231  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  57.98 
 
 		 196 aa  231  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  57.98 
 
 		 196 aa  231  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  57.45 
 
 		 196 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  57.45 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  57.45 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  57.45 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  57.45 
 
 		 196 aa  229  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  50.54 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  51.37 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  51.11 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  47.03 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  43.39 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  48 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  41.62 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  41.4 
 
 		 318 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  39.04 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.5 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.5 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  39.46 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  39.04 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  41.53 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.98 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.83 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.79 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  38.92 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.59 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.57 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  41.71 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  41.71 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.38 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.57 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.02 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.78 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.52 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.98 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  35.83 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  38.71 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.06 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.46 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  37.97 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.91 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.7 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.04 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.48 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.22 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.02 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.84 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  34.05 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  36.65 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  38.5 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  38.1 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  36.96 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  36.96 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>