More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A23 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  49.45 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  49.03 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  39.66 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  36.26 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  35 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.54 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.93 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.89 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.89 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.8 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  44.3 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.19 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.34 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.34 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.86 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  35.11 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  39.72 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.54 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  41.35 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.6 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  35.48 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  37.65 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  32.97 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  34.74 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.86 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  33.7 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  40.77 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36.72 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  35.8 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.9 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  32.79 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  34.07 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.92 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.27 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.67 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  34.41 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  32.24 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.24 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.14 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  32.24 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.16 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  32.24 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  32.24 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  32.24 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  35.03 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  37.33 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.24 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.72 
 
 		 309 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0445  resolvase/integrase-like protein  35.75 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  32.79 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  34.83 
 
 		 313 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.09 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  37.33 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  33.87 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.55 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  34.95 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  31.67 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  33.52 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  32 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.5 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  36.69 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.21 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  34.41 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  40.16 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  38.1 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  34.5 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  37.24 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  37.24 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  41.09 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  37.24 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  32.95 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  40.41 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>