More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2781 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  86.63 
 
 		 190 aa  339  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  70.37 
 
 		 189 aa  274  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  60.11 
 
 		 202 aa  224  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  56.45 
 
 		 318 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  52.03 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  52.03 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  44.04 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  46.43 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  51.33 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  44.15 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  49.32 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  42.02 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  48 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  48 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  43.55 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  45.65 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  41.62 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  45.95 
 
 		 196 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  45.95 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  45.95 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  45.95 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  44.57 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  45.89 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  45.89 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  45.27 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  45.89 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  50 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  44.62 
 
 		 217 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  39.34 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  39.89 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  34.43 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.43 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.1 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  35.71 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  36.51 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.96 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 231 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  39.33 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.98 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  35.16 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.38 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.9 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.87 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.86 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  35.48 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.08 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.95 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  35.67 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  32.63 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  38.36 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  35.33 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 305 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.84 
 
 		 309 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40.41 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.3 
 
 		 219 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  32.28 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  33.33 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 307 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 307 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  36.27 
 
 		 380 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  37.33 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.63 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  42.36 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  33.33 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  33.87 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.02 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  35.79 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.51 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  35.75 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.51 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  33.7 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  39.6 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36.65 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>