More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0011 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  100 
 
 		 181 aa  360  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  75.98 
 
 		 185 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  73.74 
 
 		 183 aa  268  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  73.3 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  71.67 
 
 		 186 aa  261  3e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  72.73 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  69.44 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0273  resolvase/recombinase  52.54 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  42.13 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  41.57 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  42.39 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  39.46 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.78 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  39.66 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40.54 
 
 		 197 aa  117  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.66 
 
 		 197 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.59 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.04 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  41.24 
 
 		 290 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.04 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  41.76 
 
 		 198 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.46 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.91 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  38.67 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 313 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  38.55 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.11 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.78 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  38.12 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.81 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  37.97 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.34 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  36.41 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  36.76 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  40.67 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  38.67 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  35.48 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  36.26 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  37.85 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  38.59 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  36.26 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.81 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  36.9 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  35.71 
 
 		 187 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  37.13 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  34.07 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.64 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  38.38 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  37.91 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  38.04 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  38.04 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.62 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.57 
 
 		 219 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.9 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  37.5 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  37.5 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.48 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>