283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0876 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  85.6 
 
 
251 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  80.88 
 
 
251 aa  427  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  77.29 
 
 
252 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  38.06 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  27.64 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  27.36 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  29.79 
 
 
185 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  28.06 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  31.41 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  29.95 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  27.55 
 
 
194 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  31.21 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  28.29 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  29.5 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 
200 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  30.35 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  30.35 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 
307 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 
307 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  31.93 
 
 
217 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  31.37 
 
 
191 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  30.73 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  28.71 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  25.6 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  28.23 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  32.84 
 
 
193 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.47 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  31.98 
 
 
199 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  31.98 
 
 
199 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  31.98 
 
 
199 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  32.7 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  29.35 
 
 
201 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  30.26 
 
 
189 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  33.55 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  26.21 
 
 
184 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  26.7 
 
 
183 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  27.55 
 
 
183 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.55 
 
 
183 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  25.62 
 
 
201 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  31.76 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  36.48 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  32.74 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.91 
 
 
515 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  31.82 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  30.26 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  31.37 
 
 
515 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  34.69 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  33.6 
 
 
128 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.26 
 
 
462 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  29.03 
 
 
192 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  26.21 
 
 
184 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  27.92 
 
 
189 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  33 
 
 
181 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  31.12 
 
 
209 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 
283 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  31.44 
 
 
191 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  32.77 
 
 
528 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.65 
 
 
534 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  32.69 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  27.14 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  30.71 
 
 
525 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  29.03 
 
 
203 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  30.67 
 
 
525 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  32.77 
 
 
528 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  36.9 
 
 
539 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  30.26 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  30.3 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  42.05 
 
 
523 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  29.72 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  42.05 
 
 
523 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.9 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  31.58 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  28.42 
 
 
199 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 
187 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  30.11 
 
 
525 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  31.39 
 
 
743 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  29.32 
 
 
537 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  31.37 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  26.54 
 
 
191 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 
380 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 
511 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  30.92 
 
 
184 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  32.05 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  29.23 
 
 
196 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 
181 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  29.22 
 
 
213 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 
213 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  31.85 
 
 
527 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  30.83 
 
 
545 aa  52.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.73 
 
 
534 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.73 
 
 
534 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>