More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1963 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  80.88 
 
 
251 aa  427  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  79.2 
 
 
251 aa  418  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  76.49 
 
 
252 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  37.6 
 
 
230 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  33.16 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  31.05 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  31.63 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  32.46 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  28.5 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  29.23 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  31.79 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  27.5 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  29.85 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  31.84 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 
203 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  28.16 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  31.37 
 
 
201 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  31.37 
 
 
201 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  29.5 
 
 
189 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.55 
 
 
183 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  27.55 
 
 
183 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 
380 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  31.77 
 
 
231 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  28.02 
 
 
183 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  33.55 
 
 
200 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.68 
 
 
515 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  29.52 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0050  DNA-invertase from lambdoid prophage Qin  29.76 
 
 
207 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112897  hitchhiker  0.000566383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  32.9 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  27.1 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  36.48 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  28.71 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  27.63 
 
 
204 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  32.16 
 
 
191 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  29.27 
 
 
169 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 
184 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  30.95 
 
 
198 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.67 
 
 
515 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32.08 
 
 
462 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  28.29 
 
 
197 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  28.66 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  32.67 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 
415 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  32.91 
 
 
522 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.33 
 
 
534 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  32.08 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  30.07 
 
 
307 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  30.07 
 
 
307 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  34.69 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  25.49 
 
 
205 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  26.4 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  30.05 
 
 
197 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  31.47 
 
 
181 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  29.02 
 
 
195 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  30.14 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 
511 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  29.61 
 
 
194 aa  55.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  25.49 
 
 
184 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  26.8 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  31.33 
 
 
192 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.33 
 
 
534 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  33.55 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.33 
 
 
534 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.22 
 
 
537 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  33.07 
 
 
128 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.33 
 
 
537 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.33 
 
 
534 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  36.9 
 
 
539 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.1 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  28.71 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  29.61 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  26.7 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  32.02 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  29.01 
 
 
184 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  26.13 
 
 
186 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
534 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  28.72 
 
 
196 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  32 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  29.05 
 
 
206 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  27.14 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  27.7 
 
 
208 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  28.93 
 
 
202 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  29.01 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  25.96 
 
 
192 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  25.96 
 
 
192 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
534 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>