28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2383 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 83 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  59.42 
 
 		 269 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  61.54 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  58.93 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  57.69 
 
 		 233 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  51.43 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  58 
 
 		 268 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  54.35 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  47.17 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  47.17 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8748  resolvase domain-containing protein  58.14 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 242 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  58.7 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  43.64 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  45.45 
 
 		 228 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  53.85 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  49.09 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  41.33 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  46.43 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  43.48 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  45.65 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  55.56 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  37.65 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  43.64 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  40.85 
 
 		 228 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  48.89 
 
 		 219 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  42.59 
 
 		 226 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>