More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2997 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 444 aa  907    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  28.06 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.68 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.73 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  27.5 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.43 
 
 		 484 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.98 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.94 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.43 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.92 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.98 
 
 		 558 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.89 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.45 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.45 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27.68 
 
 		 544 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.86 
 
 		 522 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.17 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  26.46 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.79 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.05 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  27.04 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  31.96 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  22.76 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  25.54 
 
 		 343 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.07 
 
 		 522 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  34.01 
 
 		 568 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.55 
 
 		 522 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.12 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 		 299 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.79 
 
 		 613 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  30.85 
 
 		 522 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.45 
 
 		 515 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  22.22 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.85 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  27.27 
 
 		 506 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.06 
 
 		 519 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  25.62 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  30.67 
 
 		 547 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.24 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.33 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  23.39 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  23.92 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.57 
 
 		 515 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.18 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.12 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  27.18 
 
 		 443 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.61 
 
 		 527 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.99 
 
 		 525 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  25.77 
 
 		 474 aa  89.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.73 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.1 
 
 		 525 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  31.79 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.61 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  27.22 
 
 		 525 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.61 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  23.67 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  23.67 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  23.93 
 
 		 558 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.44 
 
 		 665 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 580 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  24.61 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.35 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  26.11 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  23.62 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.85 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.65 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.65 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  26 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.71 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.12 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.08 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.33 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.22 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  29.15 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  27.51 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.53 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  25.32 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.81 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.97 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  25.16 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  23.25 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.24 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.29 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.43 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.5 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>