More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0172 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  100 
 
 
545 aa  1117    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 
568 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  43.94 
 
 
522 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  42.34 
 
 
549 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  40.78 
 
 
506 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  40.64 
 
 
550 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  40.57 
 
 
532 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  52.94 
 
 
441 aa  356  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  52.87 
 
 
443 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  50.56 
 
 
445 aa  350  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  50.43 
 
 
449 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  51.4 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  50.15 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  49.54 
 
 
445 aa  327  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  48.94 
 
 
445 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  47.37 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  47.29 
 
 
441 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  47.03 
 
 
462 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  49.14 
 
 
441 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  47.01 
 
 
441 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  47.77 
 
 
459 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  46.45 
 
 
462 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  47.99 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  49.59 
 
 
474 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  47.29 
 
 
525 aa  300  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  47.46 
 
 
525 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  47.18 
 
 
525 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  45.81 
 
 
528 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  45.81 
 
 
528 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  46.48 
 
 
527 aa  292  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  40.9 
 
 
511 aa  290  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  33.58 
 
 
500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  43.59 
 
 
534 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  33.27 
 
 
489 aa  277  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  43.3 
 
 
534 aa  276  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  40.1 
 
 
534 aa  276  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  38.11 
 
 
537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  43.02 
 
 
534 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  39.85 
 
 
534 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  42.74 
 
 
537 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  39.11 
 
 
534 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  42.25 
 
 
412 aa  253  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 
299 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 
546 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  36.26 
 
 
544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  34.89 
 
 
613 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  32.92 
 
 
665 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  34.27 
 
 
462 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  32.49 
 
 
509 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  35.94 
 
 
322 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  31.37 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  31.37 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  31.37 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  34.01 
 
 
500 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  32.14 
 
 
534 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  32.03 
 
 
552 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  26.08 
 
 
554 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  30.45 
 
 
522 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.46 
 
 
515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  35.46 
 
 
515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  32.94 
 
 
521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 
415 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.98 
 
 
475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  29.26 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  33.55 
 
 
485 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  31.56 
 
 
474 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.54 
 
 
506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  24.3 
 
 
502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  31.9 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  32.19 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.61 
 
 
558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  31.85 
 
 
484 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  29.73 
 
 
743 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.84 
 
 
553 aa  103  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  29.79 
 
 
546 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  31.96 
 
 
444 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  29.1 
 
 
303 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.59 
 
 
548 aa  97.1  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  33.6 
 
 
513 aa  97.1  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  28.53 
 
 
558 aa  97.1  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.15 
 
 
482 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27.99 
 
 
522 aa  94.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  28.46 
 
 
526 aa  94.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25 
 
 
505 aa  94  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 
494 aa  92.8  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  32.22 
 
 
281 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.66 
 
 
547 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.56 
 
 
188 aa  91.3  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  43.56 
 
 
201 aa  90.9  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  33.15 
 
 
196 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  26.47 
 
 
550 aa  90.5  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.86 
 
 
519 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 
555 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  27.71 
 
 
547 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.55 
 
 
190 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.72 
 
 
537 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  42.86 
 
 
203 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  28.18 
 
 
272 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.05 
 
 
554 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  28.82 
 
 
460 aa  87  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>