More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0512 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  50 
 
 
441 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  49.12 
 
 
441 aa  285  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  47.64 
 
 
412 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  47.89 
 
 
443 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  45.39 
 
 
568 aa  272  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  45.86 
 
 
445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  45.42 
 
 
441 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 
445 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 
445 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  45.61 
 
 
445 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  45.08 
 
 
441 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  45.05 
 
 
447 aa  262  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  43.75 
 
 
545 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  43.62 
 
 
343 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  42.28 
 
 
462 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  40.68 
 
 
527 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  41.72 
 
 
550 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  42.62 
 
 
462 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  42.05 
 
 
549 aa  238  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  45.95 
 
 
525 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  46.8 
 
 
525 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  40.6 
 
 
532 aa  235  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  40.59 
 
 
449 aa  235  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  45.19 
 
 
522 aa  234  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  41.25 
 
 
460 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  42.91 
 
 
525 aa  232  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  40.94 
 
 
459 aa  225  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  40 
 
 
506 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  37.63 
 
 
528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  37.63 
 
 
528 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  40.71 
 
 
511 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  38.38 
 
 
489 aa  215  9e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  42.9 
 
 
474 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  45.04 
 
 
534 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  40.07 
 
 
500 aa  212  7.999999999999999e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  44.27 
 
 
537 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  42.23 
 
 
534 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  41.89 
 
 
534 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  42.23 
 
 
534 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  42.23 
 
 
534 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  44.27 
 
 
537 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  42.91 
 
 
534 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  37.18 
 
 
613 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.36 
 
 
462 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  37.13 
 
 
665 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27.99 
 
 
544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  31.33 
 
 
500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.89 
 
 
515 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.41 
 
 
475 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  30.07 
 
 
546 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.62 
 
 
542 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.62 
 
 
542 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.62 
 
 
542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  37.09 
 
 
322 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  27.03 
 
 
534 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.5 
 
 
515 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  30.83 
 
 
509 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.51 
 
 
553 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.33 
 
 
546 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  31.29 
 
 
502 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
485 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.12 
 
 
534 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  26.34 
 
 
552 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.37 
 
 
415 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  34.55 
 
 
469 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  34.55 
 
 
469 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  34.55 
 
 
469 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.74 
 
 
558 aa  99.8  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 
554 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 
444 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.33 
 
 
479 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.64 
 
 
522 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  28.38 
 
 
488 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  29.76 
 
 
421 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.36 
 
 
521 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  28.52 
 
 
465 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  23.27 
 
 
272 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.4 
 
 
519 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  28.75 
 
 
547 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  31.42 
 
 
467 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  30.18 
 
 
484 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  42.2 
 
 
183 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  42.2 
 
 
183 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.59 
 
 
558 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  22.89 
 
 
474 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.59 
 
 
196 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.67 
 
 
522 aa  86.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.25 
 
 
520 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40.2 
 
 
203 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  29.82 
 
 
484 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.51 
 
 
196 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  31.37 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.08 
 
 
521 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.67 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.89 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  39.64 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.96 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  25.9 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>