More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1608 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  100 
 
 		 502 aa  1021    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  29.29 
 
 		 500 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  31.56 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  30.07 
 
 		 534 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  28.94 
 
 		 552 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.16 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  28.05 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.08 
 
 		 525 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  28.61 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  36.36 
 
 		 343 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  36.97 
 
 		 462 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  36.97 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  36.36 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  34.76 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 542 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.22 
 
 		 542 aa  124  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 542 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.17 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 537 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 534 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 534 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 534 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 537 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 534 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 534 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  35.15 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  36.97 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.08 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.8 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  35.37 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  33.01 
 
 		 550 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.24 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  31.19 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  36.36 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  36.97 
 
 		 459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  32.53 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.19 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  34.55 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.98 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  40.68 
 
 		 525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  35.37 
 
 		 568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  35.15 
 
 		 441 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  24.3 
 
 		 545 aa  113  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  34.15 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  31.29 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  33.54 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  33.95 
 
 		 544 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.71 
 
 		 665 aa  104  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.24 
 
 		 613 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.21 
 
 		 515 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  34.62 
 
 		 546 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  33.54 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.17 
 
 		 558 aa  96.7  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.94 
 
 		 426 aa  96.7  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.39 
 
 		 522 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.23 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  35.58 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  32.3 
 
 		 482 aa  93.6  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  20.47 
 
 		 546 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.84 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  34.93 
 
 		 189 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  33.12 
 
 		 494 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.12 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  25.26 
 
 		 603 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  30.86 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  35.25 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25.37 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  36.21 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25.37 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.24 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.22 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  31.71 
 
 		 211 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  29.56 
 
 		 201 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  29.56 
 
 		 201 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.55 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.94 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  24.24 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.94 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.97 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  31.71 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.09 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  36.28 
 
 		 201 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.14 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  29.03 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  27.72 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  36.28 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  34.43 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  34.19 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.89 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  34.19 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  38.89 
 
 		 213 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>