210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0567 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  100 
 
 		 577 aa  1150    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0508  Resolvase domain protein  32.73 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.97 
 
 		 426 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.44 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.36 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 485 aa  90.5  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.56 
 
 		 665 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.93 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.93 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.37 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  25.54 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.85 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  30.41 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  27.12 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  28.57 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.23 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  27.11 
 
 		 525 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.85 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.59 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.04 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.6 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  30.86 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.85 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.15 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  27.31 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  26.22 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 537 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.42 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  28.61 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.34 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.3 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  27.67 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.73 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.11 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 590 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  26.25 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  26.25 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.95 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.95 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.1 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  26.89 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.95 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.74 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  27.25 
 
 		 532 aa  72  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.57 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  25.81 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  29.84 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  30.7 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.81 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  29.02 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.52 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  18.91 
 
 		 482 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.03 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  26.72 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.17 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.92 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  28.3 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  28.3 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  28.3 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.19 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  24.71 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.87 
 
 		 500 aa  67  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  24.56 
 
 		 549 aa  67  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.52 
 
 		 509 aa  67  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  22.43 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.07 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.33 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.27 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.76 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.76 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  26.76 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  35 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  22.85 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.4 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  35 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  25 
 
 		 564 aa  63.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  26.93 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  26.86 
 
 		 542 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 568 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.09 
 
 		 529 aa  63.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.61 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  25.71 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  26.29 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.25 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4587  DNA recombinase, putative  25.71 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.77 
 
 		 565 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.7 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.96 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.13 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  20.97 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>