More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1857 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  100 
 
 		 488 aa  986    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  38.97 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  38.73 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  38.73 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  38.73 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  39.18 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  40.2 
 
 		 494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  38.88 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  38.88 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  35.24 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  35.79 
 
 		 460 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  34.26 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  35.02 
 
 		 467 aa  207  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  32.99 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  32.99 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  34.62 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  35.63 
 
 		 484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  30.9 
 
 		 503 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.18 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  30.54 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.65 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  29.59 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.46 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  30.77 
 
 		 500 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  30.15 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.03 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.62 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  27.57 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.52 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  28.84 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  27.34 
 
 		 501 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.83 
 
 		 569 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  27.63 
 
 		 506 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  27.22 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.71 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.71 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.74 
 
 		 489 aa  100  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  31.45 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.4 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.46 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  30.77 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 525 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.77 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.88 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  30.71 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  28.57 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  29.34 
 
 		 525 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  30.03 
 
 		 537 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.09 
 
 		 475 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  29.26 
 
 		 534 aa  93.6  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  27.8 
 
 		 568 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.19 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  31.2 
 
 		 281 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  29.44 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.26 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  29.26 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  30.1 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  30.48 
 
 		 462 aa  90.5  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  30.48 
 
 		 343 aa  89.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.55 
 
 		 521 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.54 
 
 		 613 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.61 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  28.37 
 
 		 445 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  29.05 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4164  hypothetical protein  25.32 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  32.29 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.35 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.35 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.18 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.74 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.11 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  31.09 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.44 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  30.26 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.36 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  28.21 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.36 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  28.87 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  28.98 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  23.86 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  23.57 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.84 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  26.74 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  25.07 
 
 		 335 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  26.96 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.53 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  21.41 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.61 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  22.1 
 
 		 603 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.36 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>